醫院以保障生殖健康為目的，保健與臨床相結合，面向群體、面向基層和預防為主”的婦幼衛生工作方針，常年為南京及周邊地區婦女兒童提供多層次、全方位健康保健和疾病預防診療服務，是中國醫院協會婦產醫院管理分會會員單位、中國婦幼保健協會常務理事單位、江蘇省醫院協會婦幼保健院分會主委單位。

近年，醫院先后建成南京醫科大學兒科學博士研究生培養點、南京醫科大學婦產科學博士研究生培養點、南京醫科大學外科學（普外）博士研究生培養點、南京醫科大學重點學科——婦產科學、生殖醫學國家重點實驗室隊列研究基地、衛生部四級婦科內鏡手術培訓基地、全國綜合(專科)醫院中醫藥工作示范單位、中華醫學會麻醉學分會產科麻醉培訓基地、中華醫學會圍產醫學分會圍產期優質護理實訓基地、國家藥物臨床試驗機構、中國妊娠期糖尿病規范化診療合作中心醫院、國家級兒童早期發展示范基地、中國出生缺陷干預救助示范基地、國家衛計委第二周期“早產（兒）干預研究”項目實施單位、中國疾病預防控制中心母嬰保健質量與安全管理項目試點單位、中國婦幼保健協會中醫中西醫結合培訓基地、中國婦幼保健協會婦科內分泌與婦科常見病培訓基地、國家孕產期保健特色專科醫院、全國第一批新生兒圍產期醫學專科醫師規范化培訓基地、國家第一批分娩鎮痛試點醫院、 中國婦幼保健協會母嬰友好醫院、國家級母嬰安全優質服務單位、江蘇省優生學質控中心、江蘇省產前診斷超聲影像中心、江蘇省住院醫師規范化培訓基地、江蘇省母嬰專科護理培訓基地、江蘇省第二批全科醫生培養省級示范臨床基地、江蘇省新生兒疾病篩查質量控制中心、江蘇省婦幼保健科研示范基地、江蘇省母乳喂養技術培訓基地、江蘇省省級孕產婦危急重癥救治中心、江蘇省省級新生兒危急重癥救治中心、江蘇省出生缺陷精準防控研究中心、江蘇省整形美容協會乳房整形技術規范培訓基地、江蘇省省級兒童早期發展基地、南京市遺傳臨床醫學中心、南京市新生兒窒息復蘇培訓中心、南京市醫學重點實驗室、南京市孕產婦危急重癥救治中心、南京市新生兒危急重癥救治中心。

醫院倡導以人為本的服務理念，建立人性化服務體系。開創產科門診"一醫一護一診室"、產科病區母嬰床旁護理新模式，省內首開二胎咨詢門診，增設產科專病、特色門診，成立高級專家會診中心，開設胎兒大學、好寶寶俱樂部；加強病員服務中心建設，拓寬預約掛號渠道，優化分時段就診，打造微信支付平臺，升級微導診服務，加大建設復診患者綠色通道；成立國內第二家、華東地區首家純公益性質的母乳庫，推進住院早產兒或疾病患兒母乳喂養，提高母乳喂養率；運用南京婦幼掌上醫院APP，大力推行預約診療、候診提醒、報告單查詢、診間付費、移動支付等功能；上線移動護理系統、產房系統、兒童體檢流程信息系統；順利完成新老醫保系統結算切換工作，上線銀醫通線上結算系統、窗口掃碼付系統，緩解門診“三長一短”現象；完成市級醫療服務監管、慢病管理、婦幼管理、分級診療、“金保二期”等系統對接。

作為具有部分公共衛生性質的婦幼保健院，醫院在政府職能履行方面承擔了南京地區全部包括省部屬和軍隊各級接產醫院在內的新生兒疾病篩查、新生兒窒息復蘇培訓、助產人員技術培訓及孕產婦保健系統管理、兒童保健系統管理、孕產婦死亡、圍產兒死亡、7歲以下兒童死亡、出生缺陷和婦女病普查情況的統計、分析、上報工作；擔負著全市近200家婦幼保健三級網絡機構的業務指導和管理工作；輔助各級政府婦幼保健政策的決策與制定。在婦幼衛生服務方面，醫院在出生缺陷預防干預、產前診斷、產科和婦科疾病診療、乳腺病診治、婦科腔鏡技術、婦女兒童健康促進等方面獨具特色，優勢突出，醫療保健服務輻射全省乃至外省市。

醫院秉承“厚德、愛生、精進、釋悅”之院訓，以推動婦幼健康事業發展、護佑婦女兒童健康為己任，努力創建“國內一流、省內龍頭”的婦幼保健院。

科研發展。2018年新增各類課題84項，其中國家自然科學基金20項、省自然科學基金8項；已發表論文432篇，其中SCI論文102篇；獲各類獎項12項，其中江蘇醫學科技獎三等獎2項、江蘇省衛計委新技術引進獎二等獎5項、南京市衛生與健康新技術獎一等獎3項、二等獎1項、江蘇省婦幼健康引進新技術一等獎1項。申報發明專利、實用新型、著作權等共60項。