西安交通大學醫學部（原西安醫科大學）創建于1937年，其前身為國立北平大學醫學院，1950年，改稱為西北醫學院；1956年，改稱西安醫學院；1985年，更名為西安醫科大學；2000年4月，西安醫科大學與西安交通大學、陜西財經學院三校合并，更名為西安交通大學醫學院。

《西北藥學雜志》是由西安交通大學和陜西省藥學會主辦、中國國內外公開發行的綜合性藥學學術期刊, 1986年3月創刊，以弘揚和發展中國秦巴山區優勢藥物資源及西北地區特有的民族藥為特色，為藥學工作者提供學術探討和交流的園地。刊文多年來連續被中國多種醫藥學權威文摘《中國生物學文摘》、《中國藥學文摘》、《中國醫學文摘·皮膚科學》收錄；并被美國《化學文摘》和美國《烏利希期刊指南》收錄；此外，該刊為《中國期刊網》、《中國學術期刊（光盤版）》全文收錄期刊，中國學術期刊綜合評價數據庫來源期刊，同時加盟萬方數據庫。

《中國醫學倫理學》雜志是中國關于醫學倫理學、生命倫理學的學術性專業刊物，為中國科技論文統計源期刊（中國科技核心期刊），首批入選WHO西太平洋地區醫學索引，被評為“RCCSE中國核心學術期刊（A）”， 被中國知網、萬方數據、維普資訊、中國生物醫學文獻數據庫等多家數據庫全文收錄。先后獲得第二、三、五屆中國高校特色科技期刊獎，多次被評為陜西省優秀期刊。連續兩年（2012-2013）在全國同類期刊中綜合排名第二。2013年的影響因子1.025。雜志介紹臨床醫學、醫學科研、醫學教育、生命科學、衛生改革中的道德建設、道德標準及道德難題與對策，以及國際醫學倫理、生命倫理發展的最新動態。

《西安交通大學學報（醫學版）》是由中華人民共和國教育部主管、西安交通大學主辦、面向中國國內外公開發行的國家級綜合性醫學學術刊物。刊物主要反映該校乃至中國國內外在醫學科研、教學、醫療等方面的新成果、新技術和新經驗。是中國科學引文數據庫（CSCD）、中國科技論文數據統計（核心期刊）源期刊；中文核心期刊要目總覽綜合性醫藥衛生類核心期刊、中國學術期刊評價報告（RCCSE）中國核心學術期刊；被美國化學文摘、荷蘭醫學文摘等國際權威性數據庫及中國學術期刊（光盤版）、中國期刊網等國內多種數據庫及檢索刊物收錄；為中國期刊方陣的“雙效期刊”。

《西北醫學教育》是中國最早創辦的醫學教育類學術期刊之一，創辦于1982年，1993年開始面向中國國內外公開發行，主要“捕捉”中國乃至全球范圍內最新的醫學教育研究成果。

《中國醫學教育技術》雜志創刊于1987年，原名《醫學視聽教育》，是中國國內外公開發行的科技學術類刊物，雜志由教育部主管、西安交通大學主辦，是國家科技部中國科技論文統計源期刊（科技核心期刊）。雜志是醫學領域關于現代教育技術理論研究及開發應用的惟一一份雜志，也是中華醫學會教育技術學會的會刊。

《中國皮膚性病學雜志》1987年創刊，中國國內外公開發行，月刊。是教育部主管、西安交通大學主辦的國家級皮膚性病學專業雜志。主要報道中國現代醫學及中西醫結合有關皮膚性病科學在預防、治療、教學、科研等方面的最新研究成果。為美國化學文摘、英國CABI數據庫、美國烏利希期刊指南等國際知名數據庫來源期刊；被《中文核心期刊要目總覽》列為“皮膚病學與性病學類核心期刊”，為中國科學引文數據庫CSCD來源期刊，被評為RCCSE中國核心學術期刊，被衛生部列為中國皮膚病類學術類期刊及我國性病學領域高效核心期刊，獲中國期刊方陣“雙效期刊”。為中國科技論文統計源期刊、中國生物醫學核心期刊、中國學術期刊綜合評價數據庫來源期刊。《2014版中國科技引證報告（擴刊版）》中影響因子為0.787，居皮膚病與性病學類期刊的榜首。

《現代泌尿外科雜志》于1996年創刊，2000年中國國內外公開發行，是由國家教育部主管、西安交通大學主辦的一本泌尿外科領域的專業學術期刊。主要報道泌尿外科、男科學領域的最新科研成果和臨床診治經驗。該刊是中國科技論文統計（中國科技核心期刊）源期刊；被美國《化學文摘》收錄；刊物同時入編中國期刊全文數據庫、中文科技期刊數據庫、萬方數據庫系統科技期刊群。2005年獲陜西省科技期刊審讀優秀期刊獎；2006年獲教育部科技司頒發的首屆中國高校特色科技期刊獎。2009年獲獲全國科技期刊審讀優秀期刊獎。

《國外醫學·醫學地理分冊》是由中華人民共和國教育部主管、西安交通大學主辦、面向中國國內外公開發行的國家級綜合性公共衛生學、環境醫學、地方病學學術刊物。刊物主要反映中國國內外在公共衛生學、環境醫學、地方病學等方面的科研、教學、醫療等新成果、新技術和新經驗。是國際地理聯合會健康與環境委員會會刊、中國地理學會醫學地理專業委員會會刊。被美國《化學文摘》、美國《烏利希期刊指南》、中國知網（CNKI）系列數據庫、中國核心期刊（遴選）數據庫、中國學術期刊綜合評價數據庫、萬方數據知識服務平臺、中國期刊全文數據庫、中國生物醫學期刊數據庫等多種數據庫及檢索機構收錄；為《CAJ-CD規范》執行優秀期刊、陜西省優秀科技期刊、國家新聞出版廣電總局第一批認定的國家級學術期刊。

《中國兒童保健雜志》是教育部主管、西安交通大學與中華預防醫學會聯合主辦的技術性刊物，是中國唯一一部兒童保健領域的專業性國家級刊物。被《中文核心期刊要目總覽》、中國科技論文統計源期刊（中國科技核心期刊）、美國《化學文摘》、俄羅斯《文摘雜志》、RCCSE中國核心學術期刊、中國生物醫學文獻數據庫源期刊等數據庫收錄。

《醫藥與保健》雜志是教育部主管，西安交通大學主辦的國家級醫學期刊，于1993年1月正式創刊。被《中國期刊網》、《中國學術期刊（光盤版）》全文收錄，并被列為《中國學術期刊綜合評價數據庫》來源期刊。